Kurzus nemzetközi vendég- és részidős hallgatóknak
- Kar
- Természettudományi Kar
- Szervezet
- TTK Élettani és Neurobiológiai Tanszék
- Kód
- rendbub22em
- Cím
- Rendszerbiológia és omika tudományok EA
- Tervezett félév
- Tavaszi
- ECTS
- 3
- Nyelv
- en
- Oktatás célja
- A tárgy célja a megismert ismeretkörök tárgyalása és a legfontosabb rendszerbiológiai elvek, omikai módszerek megismerése.
- Tantárgy tartalma
- A rendszerbiológia fogalma, kialakulása. Genomika, proteomika, metabolimika, ionomika, és a többi „-omics” diszciplína. Hipotézis-alapú vs. high-throughput molekuláris biológia. In vivo proteom adatgyűjtés E. coli-ban, és analízis. A fluxus megoszlás felderítése és jellemzése az E. coli anyagcsere hálózatában. Útvonal nélkülözhetőség (hálózat robusztusság) az élesztő anyagcsere hálózatában., A modularitás felderítése és jellemzése anyagcsere hálózatokban. Hálózatok hálózata: az élőlény, mint hálózatok összessége. Hálózattudományi bevezető. A valós, skálamentes hálózatok kialakulását befolyásoló tényezők – modellek és értelmezések. A hálózatok ellenőrizhetőségének feltételei. A hálózatok fraktálos természete. Rendszer ingadozások: a véletlen zaj jellemzői, forrásai, szerepe és befolyásának szabályozása biológiai rendszerekben. A modellezés alapjai. Mit modellezhetünk a biológiában? A modellek főbb típusai. A modellalkotás folyamata populációdinamikai példán. A modellalkotás folyamata reakciókinetikai, vírusdinamikai és járványterjedési példákon. Sztochasztikus folyamatok modellezése járványtani példákkal. Chip technológia a funkcionális genomikában. Hibridizációs technikák. DNS csipek előállítása, alkalmazásaik és korlátaik. Transzkriptom vizsgálatok, RNS szekvenálás, chip és RNAseq eredmények összehasonlítása. Az eredmények validálása. Fehérje- és kémiai chipek. A proteomika, mint gondolkozásmód és kísérleti stratégia. Proteomikai kísérletek kivitelezésének elvei. Mintavétel, mintaelőkészítés, tömegspektrometriás analízis. Mit várhatunk a proteomikától: alapkutatások, gyógyszeripar, patomechanizmus kutatás, diagnosztika. Az omikai kísérletek kiértékelési elvei. Betegségek rendszerbiológiai megközelítése. Biomarkerek azonosítása és felhasználása. Egyénre szabott orvoslás. Rendszerbiológiai megközelítés a farmakológiai kutatásban. Új gyógyszercélpontok azonosítása. High-throughput technikák alkalmazása a gyógyszerkutatásban.
- Számonkérés és értékelés
- k5 = vizsgajegy (5) (1 sikertelen, 5 jeles) A vizsgaidőszaki kollokviumra az előadások anyagából és a megadott szakirodalomból kell felkészülni. A vizsgához tartozik egy elektronikus írásbeli teszt, valamint kiválasztott 2 cikket kell szóban elmondani hármas csoportokban.
- Irodalomjegyzék
- Kurzus anyagai
Kurzus szakjai
Név (kód) | Nyelv | Szint | Kötelező | Tanév | ... |
---|---|---|---|---|---|
biológus (TTK-BIOLÓGUS-NMEN) | en | 7 | Kötelező | 1/2 | |
biológus (TTK-BIOLÓGUS-NMHU) | hu | 7 | Kötelező | 1/2 | |
Erasmus program keretében (TTK-ERASMUS-NXXX) | en | Kötelező |